Jean-Michel HERAUD a rejoint l'Institut Pasteur de Madagascar (IPM) en 2007 en tant que Responsable du Centre National de la Grippe pour participer activement au développement de la surveillance de la grippe en partenariat avec le Ministère de la Santé. Ses premières tâches consistaient à mettre en place et à mettre en œuvre une surveillance de la grippe dans tout le pays de Madagascar et à améliorer le renforcement des capacités dans le pays.

En 2010, il est nommé chef de l'unité de virologie à l'IPM et dirige maintenant plusieurs programmes de santé publique et de recherche couvrant une grande variété de sujets (virus de la grippe et autres virus respiratoires, Arbovirus, Hépatites, Zoonoses pathogènes ...).

Néanmoins, l'un de ses principaux sujets de recherche demeure la grippe et d'autres virus respiratoires. Actuellement, il coordonne plusieurs programmes dans le domaine de la grippe, y compris la surveillance de la grippe, le fardeau de la maladie, la saisonnalité et la propagation des virus grippaux à Madagascar.

En 2016, il reçoit la certification pour effectuer des recherches et superviser des doctorants (HDR) le plus haut diplôme de l'université française.

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