Contexte et justification
L’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) a inclus la surveillance de l’environnement (SE) dans la surveillance des Poliovirus (PV) dans le cadre du programme d’éradication de la poliomyélite, complétant ainsi la surveillance des paralysies flasques aigües (PFA). La SE peut être utilisée pour surveiller la circulation des poliovirus sauvages (PVs) et des virus dérivés des poliovirus vaccinaux (VDPV) dans la population.
Comprendre la distribution et la persistance des entérovirus (EV) incluant les PVs, dans les eaux usées de différentes zones géographiques peut fournir des informations pertinentes sur l’épidémiologie des infections aux EVs circulant dans la communauté, en particulier dans les pays à ressources limitées. Même dans les pays déclarés indemnes de poliomyélite, des enquêtes épidémiologiques et des études environnementales décrivant la présence des EVs dans les eaux usées ont été rapportées.
A Madagascar, l’épidémiologie des EVs reste incomplète car l’isolement et la détection des EVs n’ont été réalisés jusqu’à présent que sur des isolats provenant des cas de PFA. Dans cette étude, nous examinerons des échantillons environnementaux pour décrire la diversité des EVs dans les eaux usées des zones urbaines et rurales en utilisant la détection moléculaire et l’analyse de la séquence des gènes viraux.
Objectifs
Les objectifs de cette étude sont:
- La recherche des EVs et en particulier des PVs, dans les échantillons d’eaux usées ;
- L’isolement et la caractérisation (par séquençage) des isolats d’EVs collectés dans environnement.
Deux districts (Antananarivo Renivohitra et Toliara I) ont été choisis pour cette étude avec respectivement 12 sites et 3 sites de collecte.
La collection des prélèvements des eaux usées (1,5 litres) dans chaque site a été effectuée trimestriellement. Le traitement (concentration) des échantillons a été fait suivant le protocole de l’OMS. Les isolements des virus ont été réalisés en inoculant les concentrâts dans des lignées cellulaires sensibles aux EVs et aux poliovirus (RD et L20B respectivement). Tous les échantillons positifs sur L20B ont été repris pour la détection des PVs en utilisant la technique de différenciation intratypique (DIT).
Résultats et discussion
Les résultats de cette étude sont présentés dans le projet intitulé « Surveillance virologique intensive de la circulation des poliovirus avant et après introduction du vaccin polio oral bivalent » (cf. Fiche Switch VPOb).
Impact
Cette étude devrait fournir des données supplémentaires pour comprendre l’épidémiologie des EVs chez l’homme et informer les autorités sanitaires sur les risques potentiels pour la santé publique d’une contamination par des virus circulants dans l’environnement. Cette surveillance est aussi complémentaire à la surveillance des PFA car elle permet de mesurer de façon indirecte une diminution de la couverture qui pourrait conduire à l’émergence de VDPV.
