Contexte et justification
Ces dernières années, un intérêt s’est porté sur le rôle éventuel des petits mammifères terrestres et volants comme réservoirs de divers parasites. En effet, les études récemment entreprises ont permis de mettre en évidence chez les petits mammifères divers types d’infections aussi bien bactériennes (Leptospira, Rickettsia, Bartonella) que virales (Paramyxovirus, Hantavirus, Coronavirus, Lyssavirus, …) qui pourraient avoir un impact néfaste sur la santé publique. Outre ces pathogènes d’intérêt médical, les petits mammifères hébergent également des parasites qui leur sont propres mais encore peu étudiés, même si ceux retrouvés chez ces animaux présentent des relations évolutives avec ceux identifiés chez l’homme.
Bien que des études sur les parasites sanguins aient été entreprises afin d’élucider leur diversité et leur taxonomie, les informations disponibles actuelles sont loin d’être exhaustives. Ainsi, il serait important de connaître la diversité de ces parasites, de comprendre les mécanismes d’infections et de déterminer les différents facteurs pouvant influencer ces infections.
Objectifs
- Déterminer la diversité des parasites sanguins de petits mammifères à travers des études morphologiques et moléculaires ;
- Déterminer la prévalence de chaque infection pour les différentes espèces cibles ;
- Déterminer les vecteurs potentiels de chaque infection ;
- Cartographier les parasites sanguins des petits mammifères malgaches selon les zones bioclimatiques et les espèces infectées.
Méthodes
1. Collecte d’échantillons biologiques
Les petits mammifères ont été capturés à Fandanana (district de Fandriana) et à Ambohitromby, Ambohinaorina et Ambohitantely (district d’Ankazobe), en utilisant des pièges standards (National, Sherman pour les petits mammifères terrestres, et filet japonais pour les chauves-souris). Pour chaque individu capturé, des prélèvements biologiques ont été collectés et stockés pour des analyses morphologiques et moléculaires ultérieures. Après les prélèvements, l’individu a été relâché ou gardé en spécimen selon les conditions mentionnées dans les autorisations de recherches.
2. Etude morphologique
Les frottis sanguins collectés ont été fixés avec du méthanol et colorés au GIEMSA en vue de faire la lecture à faible et à fort grossissement sous microscope optique.
3. Etude moléculaire
Les individus présentant des infections ont fait l’objet d’une étude moléculaire. Pour ce faire, l’ADN de chaque échantillon a été extrait en utilisant le kit Qiagen. Des séries de PCR ont été programmé afin de déterminer les relations phylogénétiques des parasites identifiés par rapport à ceux reportés dans la littérature.
Résultats et discussion
Au total, sur 222 échantillons, provenant de 18 espèces de chauves-souris, observés sous microscope, un taux d’infection d’environ 16 % a été trouvé. D’autres frottis sanguins provenant d’autres espèces de petits mammifères sont encore en cours de lecture. Tous les échantillons positifs feront l’objet d’une étude moléculaire afin de déterminer la taxinomie et l’évolution des parasites identifiés.
Impact
Le présent projet permettra de rassembler des informations supplémentaires sur la diversité et la taxinomie de divers parasites propres aux petits mammifères de Madagascar. En outre, il nous permettra de comprendre l’évolution de divers parasites sanguins retrouvés dont plusieurs genres ont été retrouvés aussi bien chez les petits mammifères que chez d’autres groupes de mammifères (Primates, Homme).