Contexte et justification
Les petits mammifères jouent un rôle important dans la maintenance et la transmission de différentes zoonoses dont la majorité constitue un problème de santé publique. En effet, suite à diverses investigations, la circulation de quelques pathogènes chez les petits mammifères a été mise en évidence et l’homme pourrait s’infecter après un contact direct ou indirect. A Madagascar, la connaissance des parasites associés aux petits mammifères est loin d’être exhaustive, augmentant ainsi le risque d’infection pour la population humaine vivant à proximité de leur habitat naturel. Dans le cadre de ce projet, nous allons essayer de déterminer à petite et à grande échelle, l’épidémiologie de différentes bactéries pathogènes afin de mieux identifier les risques pour l’homme, améliorer le système de riposte et prévenir toute émergence ou réémergence de maladies. Pour ce faire, nous nous proposons d’étudier les bactéries pathogènes circulant chez ces petits mammifères et leurs ectoparasites (vecteurs potentiels). Par ailleurs, nous allons également déterminer le rôle des facteurs abiotiques sur les infections afin d’émettre des hypothèses liées à la présence et à la maintenance de divers pathogènes à travers le système de transmission vectoriel d’une part et de déterminer leurs implications potentielles dans la santé publique d’autre part.
Objectifs
- Identifier des pathogènes (bactéries, virus) associés aux petits mammifères terrestres et volants ainsi que leur réservoir potentiel ;
- Déterminer la prévalence de chaque pathogène chez les réservoirs et leurs ectoparasites ;
- Déterminer des facteurs pouvant influencer leur maintenance et leur circulation ;
- Déterminer les vecteurs potentiels de agents pathogènes étudiés ;
- Modéliser la relation hôte-vecteur-parasite à différents niveaux.
Méthodes
1. Collecte d’échantillons biologiques
Les petits mammifères terrestres ont été capturés dans le District de Fandriana et d’Ankazobe en utilisant des pièges standards. Pour chaque individu capturé, des prélèvements biologiques ont été collectés et stockés pour des analyses ultérieures. Par ailleurs, des gouttes de sang sur du papier buvard par individu ont été également prélevées pour les analyses sérologiques et moléculaires. Selon le site étudié, les petits mammifères volants ont été également échantillonnés à l’aide de filet japonais.
2. Analyse des échantillons biologiques
Le portage de différentes bactéries par les petits mammifères sera évalué par diverses techniques bactériologiques, sérologiques et moléculaires selon le pathogène cible.
Résultats et discussion
Au total, 196 petits mammifères ont été collectés dans les deux districts étudiés dont 13 individus de chauves-souris. La séroprévalence pour la peste a été de 12 %. En outre, l’étude des autres parasites associés aux petits mammifères à travers des techniques bactériologiques et moléculaires sont encore en cours. Pour les ectoparasites collectés, en l’occurrence des tiques, des puces et des acariens, les identifications morphologiques ont été entreprises et les individus collectés font actuellement l’objet de différents tests moléculaires pour voir les parasites qu’ils hébergent.
Après cette étape d’identification, des études de prévalence seront entreprises afin de comprendre leurs déterminants et le risque potentiel pour l’homme.
Impact
Ce projet permettra d’établir un protocole d’échantillonnage et d’étude en vue d’une surveillance à long terme des pathogènes d’importance médicale et/ou vétérinaire, de comprendre les mécanismes favorisant la circulation et la transmission de divers pathogènes chez les petits mammifères et d’anticiper toutes actions visant à réduire ou à éviter les risques d’infections ou d’épidémies dues à des infections mal connues.
