Contexte et justification
Les entérovirus humains A 71 (EV-A71) sont des agents pathogènes émergents qui circulent dans le monde. Ils sont responsables de la maladie de mains-pieds-bouche et peuvent provoquer des encéphalites graves chez les enfants. Actuellement, il n’existe pas de prophylaxie ni de traitement spécifique.
Les EV-A71 sont partagés en 4 génogroupes : B et C qui sont ubiquitaires et circulant notamment en Asie ; et E et F récemment découverts en Afrique et à Madagascar.
Objectifs
Les objectifs de cette étude sont de :
- Déterminer la circulation et la diversité des EV-A71 en Afrique à travers les 5 Instituts du Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP) : IP Madagascar, IP Tunis, IP Côte d’Ivoire, CP Cameroun, IP Algérie et IP Paris ;
- Faire des analyses comparatives : génotypiques, phénotypiques et pathogénicités des souches des nouveaux génogroupes.
Méthodes
Nous avons utilisé les isolats des extraits de selles positifs en entérovirus non poliomyélitiques (ENPV) dans le cadre de la surveillance des cas de paralysie flasque aigüe (PFA) depuis 2014.
La technique d’amplification génique spécifique (RT-PCR en temps réel) a été utilisée pour détecter les EV-A71. Le test inclus un témoin interne (ICEV-A71) qui permet de s’affranchir des faux négatifs dus à des inhibiteurs et un témoin positif. La réaction RT-PCR amplifie un segment du gène 1D codant pour la protéine VP1 (une des 4 protéines de capside)
Résultats et discussion
Parmi les, 474 échantillons positifs en ENPV (210 en 2014-2015 et 264 isolats en 2016), suite à un problème technique, seulement 69 isolats ont bénéficié d’un test moléculaire, . Un était positif pour EV-A71.
Le problème technique ayant été résolu (changement de la marque d’enzyme), l’analyse des autres prélèvements est en cours.
Impact
La mise en évidence de la circulation des EV-A71 à Madagascar permettra d’alerter les autorités malgaches sur les risques de la maladie de pieds-main-bouche et d’évoquer cette étiologie dans certains cas de méningite.