Collections

Collections biologiques actuelles et à venir du CRB-IPM

Le CRB-IPM héberge des collections biologiques riches en spécimens accumulés au cours du temps qui répondent à des besoins fondamentaux de la recherche. Ces collections sont d’une grande importance notamment dans :

• des enquêtes d’épidémiologie moléculaire lors d’une nouvelle épidémie ;
• l’étude de l’évolution des souches au cours du temps et la modélisation de cette évolution ;
• l’obtention de souches de référence en recherche biomédicale, fondamentale et diagnostics cliniques ;
• la recherche de nouveaux mécanismes de résistance ou de pathogénicité ;
• …

Souches bactériennes résistantes aux carbapénèmes

Actuellement, le CRB-IPM dispose dans sa collection des souches bactériennes résistantes aux carbapénèmes. Ce sont des bactéries à Gram négatif isolées de différents projets réalisés au sein du laboratoire de Bactériologie expérimentale et du Centre de Biologie Clinique de l’IPM.

L’analyse moléculaire complète des génomes des 33 souches a été réalisée. Les caractéristiques phénotypiques sont disponibles sur demande. La technologie de spectrométrie de masse MALDI-TOF a été utilisée pour l’identification de ces souches résistantes, ainsi que le séquençage complet du génome par séquençage Illumina et la bioinformatique.

Les données obtenues de ces analyses permettront de :

• d’informer et d’orienter la prescription du clinicien en terme d’antibiothérapie suite à l’émergence de ces souches;
• de connaître les supports moléculaires impliqués dans la résistance hébergés par ces souches circulant à Madagascar;
• de fournir des données sur l’épidémiologie des souches résistantes aux carbapénèmes circulantes à Madagascar ;
• de sensibiliser le personnel soignant et le pouvoir public pour la mise en place des programmes de surveillance et de la résistance au sein des communautés et services hospitaliers.

Plusieurs autres collections phares de l’IPM sont prévues être intégrées au CRB-IPM au cours de l’année 2019, entre autres, les souches d’Yersinia pestis, des souches d’arbovirus…