La 4ème édition de la Journée des doctorants, organisée par la direction scientifique de l’Institut Pasteur de Madagascar (IPM), s’est déroulée le vendredi 30 novembre à la salle de conférence de l’IPM. Cette journée d’échanges scientifiques et de cohésion entre les doctorants en sciences a permis de faire une revue des travaux de thèse en cours au sein de l’IPM. Douze doctorants en sciences accueillis ou en poste dans les différentes unités de recherche de l’IPM ont présenté leurs projets de thèse ainsi que l’avancement de leurs travaux respectifs. Chaque présentation a été suivie d’une discussion avec l’audience composée de chercheurs de l’IPM et de l’université d’Antananarivo.
Les doctorants de l’Institut Pasteur de Madagascar
Les différents projets présentés :
Investigation écologique et identification des organismes parasites du sang des chiroptères frugivores de Madagascar
Unité de Virologie, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de l’Environnement, Faculté des Sciences, Université d’Antananarivo
Ce travail a pour objectif principal d’investiguer le rôle potentiel que peuvent jouer les chiroptères frugivores de Madagascar en tant que réservoir de parasites sanguins. Nos résultats montrent pour la première fois la présence d’organismes parasites du sang chez les chiroptères frugivores malgaches, étendant ainsi la capacité de ces animaux à héberger des organismes pathogènes et le risque qu’ils peuvent représenter pour les populations humaines.
Etude sur le portage asymptomatique de parasites intestinaux chez des enfants malnutris et normonutris à Antananarivo
Unité des Helminthiases et Unité de Bactériologie Expérimentale, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de l’Environnement, Faculté des Sciences, Université d’Antananarivo
Cette étude a pour objectif principal d’étudier la prévalence du portage asymptomatique des parasites intestinaux chez des enfants malnutris et normonutris à Antananarivo. Dans cet objectif, nous allons déterminer la charge moyenne de chaque parasite suivant les méthodes utilisées, évaluer les différentes méthodes de diagnostic utilisées en termes de sensibilité et de spécificité par parasite étudié, et comparer la diversité des microbiotes intestinaux en fonction du portage des parasites et de l’état nutritionnel de l’enfant. Cette étude s’inscrit dans deux projets de recherche multidisciplinaires et multi-pays AFRIBIOTA et MALINEA.
Différences entre zones urbaines et rurales sur les causes de décès à Moramanga, Madagascar
Unité d’Epidémiologie et Recherche Clinique, Institut Pasteur de Madagascar
DemoSud, Institut national d’études démographiques, Paris France
L’objectif de ce travail est d’estimer l’ampleur des inégalités en santé entre les zones urbaines et rurales de Madagascar. Ce projet de recherche se focalise sur la mortalité en analysant les causes de décès en zone urbaine et rurale à Moramanga.
Epidémiologie et caractérisation moléculaire du White Spot Syndrome Virus (WSSV) à Madagascar
Laboratoire d’Hygiène des Aliments et de l’Environnement (LHAE), Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de l’Environnement, Faculté des sciences, Université d’Antananarivo
Ce projet a pour objectif de mieux comprendre le statut et la circulation, l’origine et les caractéristiques du virus du syndrome des points blancs chez les crustacées de Madagascar, virus responsable de la maladie des points blancs afin de trouver des mesures de lutte efficace contre l’introduction répétée du virus ou la propagation de la maladie à Madagascar.
Mise en évidence de la résistance aux pyréthrinoïdes et au bendiocarbe chez les populations d’Anopheles funestus de Tsararano Marovoay.
Unité Groupe G4 Malaria ; Unité de Recherche sur le Paludisme ; Unité d’Entomologie Médicale, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Génie du Vivant et Modélisation, Université de Mahajanga
Cette étude a permis de mettre en évidence que des populations d’Anopheles funestus collectées dans la commune de Tsararano, Marovoay sont résistantes aux pyrethrinoïdes et au bendiocarbe. Ces résultats constituent une menace réelle pour le programme national de contrôle du paludisme à Madagascar, qui repose principalement sur les Campagnes d’Aspersions Intradomiciliaires d’insecticides et la distribution en masse de Moustiquaires Imprégnés d’Insecticides.
Etude des parasites sanguins des petits mammifères de Madagascar
Unité Peste, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de l’environnement, Faculté des Sciences, Université d’Antananarivo
Cette étude a été menée pour avoir une vue globale des parasites et pathogènes circulant chez ces petits mammifères de Madagascar et d’évaluer le risque potentiel que ces parasites pourraient avoir sur la santé humaine. A Madagascar, ces études sur les parasites propres aux petits mammifères ont été faiblement abordées. Nos résultats montrent que les petits mammifères terrestres et volants de Madagascar hébergent des parasites spécifiques qui ont des affinités évolutives avec ceux infectant les êtres humains. Cependant, l’effet de ces infections sur leur hôte reste à élucider.
Diagnostic et prévalence de la leptospirose humaine en milieu hospitalier à Madagascar
Unité d’Immunologie des Maladies Infectieuses, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole doctorale Sciences de la vie et de l’environnement, Faculté des sciences, Université d’Antananarivo
Cette étude a pour objectif de mettre en place un diagnostic sérologique et moléculaire adapté aux sérovars de leptospires circulants à Madagascar pour renforcer l’identification des cas incidents et la surveillance de la leptospirose en milieu hospitalier.
Mécanisme de saisonnalité et étude phylodynamique du virus respiratoire syncytial circulant à Madagascar
Unité de Virologie, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de l’Environnement, Faculté des Sciences, Université d’Antananarivo
Le Virus Respiratoire Syncytial (VRS) constitue la première cause des infections respiratoires aigües virales chez les enfants âgés de moins de 5 ans à Madagascar. Une meilleure compréhension des facteurs responsables des réintroductions régulières et de sa dynamique de circulation à l’échelle nationale constitue un élément clé pour prévenir la survenue d’une épidémie, mais également pour adopter une stratégie de surveillance et appliquer des mesures de contrôle, dont la vaccination. La saisonnalité du VRS sera étudiée en prenant en compte les facteurs météorologiques ainsi que le flux des voyageurs entrant à Madagascar pendant les mêmes périodes. Des souches de VRS seront séquencées pour des analyses phylogénétiques et phylogéographiques bayésiennes afin d’étudier la dynamique de diffusion du virus à travers le pays.
Rôle d’Anopheles coustani et d’Anopheles squamosus dans la transmission du paludisme à Madagascar : diversité intra-spécifique et compétence vectorielle
Unité d’Entomologie Médicale, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de L’Environnement, Faculté des Sciences, Université d’Antananarivo
A Madagascar, la transmission du paludisme est très hétérogène en lien avec les différents domaines bio-climatiques et la diversité anophélienne existante. Deux espèces d’anophèles Anopheles coustani et An. squamosus qui présentent une répartition très large et peuvent se révéler particulièrement abondantes localement, ont de longue date été soupçonnées de jouer un rôle dans la transmission du paludisme à Madagascar. Cette étude a pour objectifs d’étudier la diversité intra-spécifique au sein des 2 espèces d’Anophèles en vue de rechercher l’existence éventuelle de complexes d’espèces et caractériser la compétence vectorielle de différentes populations des deux espèces vis-à-vis des souches plasmodiales circulantes au regard des taux d’infection naturelle.
Facteurs d’exposition de la population malagasy aux hantavirus et étude génétique des souches d’hantavirus circulant à Madagascar.
Unité de Virologie, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de l’Environnement, Faculté des Sciences, Université d’Antananarivo
L’objectif de cette thèse est d’étendre les connaissances sur les hantavirus qui circulent à Madagascar, aussi bien chez l’homme que chez les animaux réservoirs. Pour cela, nos questions de recherche tenteront (i) d’évaluer les facteurs de risque associés à l’exposition aux hantavirus chez l’homme, (ii) d’évaluer les facteurs de risque liés à l’infection des micromammifères, et (iii) d’étudier la variabilité génétique intra-souche des hantavirus circulant à Madagascar.
Propreté et souillure à Antananarivo (Madagascar). Quels liens avec la malnutrition chronique ?
Groupe Santé et Sciences Sociales, Unité d’Epidémiologie et Recherche Clinique, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole doctorale Sociétés, Politique et Santé Publique (EDSP2), Université de Bordeaux
A Madagascar, la malnutrition chronique ou le retard de croissance, touchant 47,3% des enfants de moins de 5 ans, présente un problème de santé publique majeur. L’effet de contamination du milieu de vie, dû entre autres aux problèmes liés à l’assainissement, semble jouer un rôle important dans la survenue de cette forme de malnutrition. Pourtant, tous les enfants vivant dans un tel milieu de vie n’ont pas forcément une croissance entravée, étant le cas dans les quartiers défavorisés d’Antananarivo. Cette thèse de doctorat examinera pourquoi il en est ainsi, tout en explorant les contributions de la compréhension locale de la propreté et de la souillure à la santé et à la croissance des enfants. Cette étude anthropologique s’inscrit dans le cadre du projet « Afribiota ». Cette étude contribuera à mieux comprendre les notions de retard de croissance et de l’effet de contamination du milieu de vie, et les pratiques en matière de propreté et de souillure dans une zone défavorisée d’Antananarivo.
Télédétection et modélisation spatiale : application à la surveillance et au contrôle du paludisme à Madagascar
Groupe Santé et Géomatique, Unité d’Epidémiologie et Recherche Clinique, Institut Pasteur de Madagascar
Ecole doctorale ? Université de ?
L’objectif de cette thèse est de développer un modèle spatial qui permettra de simuler, par une approche de télédétection multi-capteurs, la propagation spatio-temporelle d’agents pathogènes vectorisés, avec comme exemple les moustiques Anophèles, vecteurs du paludisme à Madagascar. Le modèle permettra d’étudier l’impact de modifications anthropiques de l’environnement (ex. changements d’utilisation des sols), d’un changement climatique (ex. augmentation des températures) sur les dynamiques de population du vecteur et d’infection des hôtes. Le modèle sera utilisé pour évaluer différents scénarios de changements globaux, ainsi que de potentielles stratégies de contrôle des épidémies, visant soit les vecteurs, soit les hôtes.